В этой платежной системе, независимо друг от друга существуют 2 разных электронных кошелька - Интернет.Кошелек и Яндекс.Кошелек. Доступ к первому осуществляется через программу, ко второму - посредством веб-интерфейса системы Yandex.Деньги. Кошельки не взаимозаменяемы, имеют разные номера, поэтому следует выбрать один из них, либо завести сразу оба.